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bo

lundi 30 avril 2018

Prélèvement en Bactériologie


Prélèvement en Bactériologie


Prélèvement d’urines pour ECBU

Les prélèvements doivent être réalisés de préférence avant tout traitement antimicrobien.

Chez la femme :
1.      Se laver les mains soigneusement à l’eau et au savon, sécher avec une serviette propre.
2.      Nettoyer soigneusement la partie vulvaire, de l’eau savonneuse.
3.      Rincer à l’eau et sécher.
4.      Uriner en éliminant le premier jet dans les toilettes, recueillir les urines du milieu de la miction dans le récipient, la fin de la miction doit être faite dans les toilettes.
5.      Fermer le récipient soigneusement.

Chez L’homme :
1.      Se laver les mains soigneusement  à l’eau et au savon et les sécher. 
2.      Dégager le gland, le nettoyer l’eau savonneuse chaude.
3.      Eliminer le premier jet d’urines dans les toilettes.
4.      Recueillir les urines du milieu de la miction dans un récipient stérile et renfermer soigneusement en évitant les contaminations. Terminer la miction dans les toilettes.

Chez l’enfant et le nourrisson :

o   Chez le nourrisson :
1.      Préparer une poche en plastique.
2.      Faire boire au nourrisson autant d’eau que possible juste avant la collecte des urines.
3.      Désinfecter au dakin la zone méatique, ainsi que toute la surface cutanée ou sera placée la poche.
N.B : Ne jamais laisser la poche en place plus de 30 à 40 min.
o   Chez l’enfant :
-          Faire boire à l’enfant d’eau que possible juste avant la collecte des urines.
-          Désinfecter au dakin ou à l’eau savonneuse, la zone méatique.
-          L’enfant peut être assis sur les genoux de sa mère.
-          Recueillir le plus d’urines possible dans un récipient stérile, le renfermer soigneusement.
      Conservation et transport :
Les échantillons d’urines doivent être transportés au laboratoire dans l’heure qui suit la collecte. Si le transport ne peut pas être immédiatement assuré, l’échantillon d’urine doit être conservé dans le réfrigérateur et manipulé dans les 24 heures.

Prélèvement d’urines pour le compte d’addis 

Prélèvement est effectué le matin.
1.      Demander au malade de vider sa vessie et de boire un grand verre d’eau.
2.      Le malade reste allongé pendant 3 heures.
3.      Recueillir la totalité des urines des 3 heures dans le flacon prévu pour le prélèvement.


 Conservation et transport :
Prélèvement doit être rapidement acheminé au laboratoire dans les 4 heures à température ambiante.
Prélèvement des selles pour coproculture 

-          De préférence avant toute utilisation d’antibiotiques.
-          L’échantillon doit être prélevé le matin.
-          Les selles doivent être collectées dans un pot stérile.
-          Fermer le récipient et le transférer au laboratoire.
Ecouvillonnage rectal :
-          Ne doivent être utilisés que si le patient est incapable de produire un échantillon de selles.
-          Un écouvillon stérile à extrémité en coton, humidifié avec de l’eau physiologique stérile est introduit au-delà du sphincter rectal, subi quelques rotations avant d’être retiré et placé dans un tube stérile bien fermé.
-          Les échantillons de selles soigneusement emballés, doivent être analysés dans les 2 heures qui suivent le prélèvement.

Prélèvement génitaux 

Les prélèvements génitaux doivent être faits de préférence avant tout traitement antibiotique, le matin avant la miction ou deux heures après la miction .
Chez la femme :
Prélèvement vaginal :

1.      Demander à la patiente de faire sa toilette intime la veille au coucher.
2.      La patiente est placée en position gynécologique.
3.      Mettre en place le spéculum.
4.      A l’aide d’écouvillon en alginate ou en dacron stériles, prélever les sécrétions au niveau du cul-de-sac postérieur du vagin.
Un premier écouvillon va servir à ensemencer, sur place, le milieu de culture .Deuxième écouvillon sera adressé pour l’examen direct.

                                Prélèvement endocervical :

1.      Placer la patiente en position gynécologique.
2.      Eliminer la glaire cervicale avec du gaz stérile en utilisant la pince.
3.      Introduire un écouvillon en lui imprimant un mouvement de rotation pendant au moins dix secondes, avant de le retirer.
4.      Ensemencer directement un milieu de culture approprié.
5.      Un deuxième écouvillon au laboratoire, pour l’examen direct.


Chez l’homme :
Prélèvement au niveau de l’urètre :

1.      En présence d’un écoulement visible, la goutte est collectée à l’aide de deux écouvillons. Le premier est utilisé immédiatement pour la préparation d’un frottis fin et le second pour l’inoculation d’un milieu de culture.
2.      En absence d’un écoulement visible.

Prélèvement de sperme :

1.      Une abstinence sexuelle de 3 jours est requise.
2.      Effectuer le prélèvement après une miction suivie d’une désinfection et un rinçage soigneux du gland.
3.      Le sperme est recueilli, en totalité, dans un tube ou un flacon stérile.

Liquide céphalo-rachidien :


Prélever dans le cadre d’une méningite infectieuse bactérienne, virale ou parasitaire.
Conservation et transport :
Le transport doit être très rapide et s’il nécessite plus d’une heure, le prélèvement doit être envoyé au laboratoire à 35°C, jamais au froid.
Non conformité du prélèvement :
L’échantillon refusé en cas de :
§  Absence d’étiquette sur le tube.
§  Absence d’ordonnance.
§  Absence d’identification du patient, incomplet erronée ou non déchiffrable.
§  Tube non stérile, ouvert, mal fermé ou cassé.
§  Tube acheminé au laboratoire à température ambiante plus d’une heure après prélèvement.
§  Tube transporté au froid.



Liquide péritonéal 

Prélèvement :
 est effectué avant toute utilisation d’antibiotiques
Conservation et transport :
Si la durée de transport dépasse une heure, transporter  les échantillons dans une caisse isotherme à 2-8°C.
Prélèvement non conforme :
§  Absence d’étiquette sur le tube.
§  Absence d’ordonnance.
§  Absence d’identification du patient, incomplet erronée ou non déchiffrable.
§  Tube non stérile, ouvert, mal fermé ou cassé.
§  Tube acheminé au laboratoire à température ambiante plus d’une heure après prélèvement.
§  Tube transporté au froid.

Prélèvement ORL

Prélèvement au niveau de l’oreille :
Le but de ce prélèvement  est le diagnostique étiologique des infections de l’oreille externe et moyenne par mis en culture aérobie et anaérobie et étude de la sensibilité aux antibiotiques des germes isolés.
Matériel :
Ecouvillons en coton ou en dacron.
Seringue, aiguille.
Tube stérile.
Piège à vide stérile.
Milieu de transport.
Moment du prélèvement :
Le prélèvement est réalisé avant la prise d’antibiotiques.


Procédure :

Oreille externe :
1.      Installer le patient en position assise.
2.      Utiliser un premier écouvillon humide pour éliminer les débris et croutes du conduit auditif externe.
3.      Effectuer ensuite le prélèvement à l’aide de 2 écouvillons en appuyant fermement sur les parois de l’oreille. Un écouvillon servira à l’examen microscopique et l’autre à la mise en culture.
Conservation et transport :
Si les échantillons ne sont pas analysés dans l’heure qui suit le prélèvement, ils seront transportés, de préférence à +4°C.
Les échantillons peuvent être conservés de deux heures à 20°C sans milieu de transport et moins de douze heures à 20°C en cas d’utilisation de milieu de transport.
Non-conformité du prélèvement :
·         Identification absente, erroné ou incomplète.
·         Discordance entre l’ordonnance et le prélèvement
·         Ecouvillon non stérile.
·         Ecouvillon sec.
·         Ecouvillon contenant des débris de croutes du conduit auditif.
·         Temps et température de transport non respectés.
·         Absence de milieu de transport si l’échantillon est acheminé au laboratoire plus de 2h après le prélèvement.

Prélèvement de gorge et du rhinopharynx 

  •  Permet de confirmer le diagnostique de pharyngite streptococcique, de diphtérie, d’épiglotite, de stomatite de Vincent et de candidose buccale.
  •   Permet d’établir le foyer infectieux de la fièvre scarlatine, la fièvre rhumatismale et de la glomérulonéphrite aigue
  •   Permet d’identifier les porteus de bacilles diphtériques, gonococciques et méningococciques.

Matériel :
  1.       Écouvillons à bouts en coton.
  2.       Abaisse-langue.
  3.       Milieu de transport.

Moment du prélèvement :
Le prélèvement est effectué au cours de le phase aigue de la maladie et avant tout traitement antibiotique.
Procédure :
Dirigé la lumière de façon à bien éclairer la cavité buccale et demander au patient d’ouvrir largement sa bouche et de dire AH, ensuite abaisser doucement la langue du patient avec un abaisse –langue stérile.
Introduire un écouvillon dans le pharynx au dessus de la langue. Eviter de toucher les lèvres , le plais et la langue avec écouvillon.
Gratter fermement l’écouvillon contre l’arrière  de la gorge, les deux amygdales et toute autre zone présentant une inflammation, exsudation ou ulcération.
Conservation et transport :
Si l’écouvillon peut être manipulé dans les deux heures qui suivent le prélèvement, il faut le placer dans un tube stérile et le fermer avec un bouchon. Si la manipulation est retardé, placer l’écouvillon dans le milieu de transport, casser l’extrémité non stérile qui a été en contact avec les doigts, puis replacer le bouchon.
Non conformité du prélèvement :
·         Identification patient absente, erroné ou incomplète.
·         Absence de bon de demande d’examen.
·         Ecouvillon non stérile.
·         Ecouvillon sec ou ouvert.
·         Ecouvillon contenant des débris de croutes du conduit auditif.
·         Temps et température de transport non respectés.
·         Absence de milieu de transport si l’échantillon est acheminé au laboratoire plus de 2h après le prélèvement.



Crachats :
Il ne faut pas examiner des expectorations constituées de salive et de particules alimentaires.
Le prélèvement est effectué avant l’utilisation d’antibiotiques, le matin de préférence à jeune.

              Procédure :
-          Le patient doit se tenir debout si possible ou assis en se tenant droit,
-          Le patient doit inspirer profondément pour remplir ses poumons avec de l’air et expirer en une seule fois, toussant aussi fort et aussi profondément que possible.
-          Le crachat qui remonte doit être versé dans le pot à crachats.
-          Une collecte de crachats de 24 heures ou le recueil de 3 échantillons de crachats n’est utile qu’en cas d’infection à mycobactéries.
-          Renfermer le flacon et envoyer l’échantillon immédiatement au laboratoire.
-          La conservation et le transport se font à 2 – 8 °C dans une glacière, sauf si la durée du transport est inférieure à une heure.

Prélèvement de pus

Le but de cette analyse est le diagnostic étiologique des infection purulentes cutanées et viscérales .
Matériel 
Solution antiseptique, pinces stériles, seringues, aiguilles, coton, écouvillons stériles, gazez et des pansements stériles, milieu de transport.
Le prélèvement droit être réalisé de préférence avant l’administration d’antibiotiques.
Procédure
Par aspiration :
-          Informer le patient
-          Prendre de la gaze avec une pince, l’imbiber d’alcool et décontaminer les bords de a lésion. Laisser sécher l’alcool.
-          Introduire l’aiguille dans la zone décontaminée et aspirer les sérosités en profondeur de la plaie.
-          Déposer quelques gouttes de ces sérosités sur un écouvillon en coton et les plonger dans le tube de milieu de transport. Le reste est déposé sur une lame pour la réalisation d’un frottis.
-          Faire un pansement.

Par écouvillonnage :
-          Informer le patient.
-          Oter le pansement avec pince.
-          Prendre de la gaze avec pince, la tremper dans une solution saline et laver la surface de la lésion ou de l’ulcère.
-          Retirer l’écouvillon de son étui et placer le bout profondément dans la plaie. Faire attention à ne pas toucher les bords adjacents.
-          Enlever le bouchon du tube de milieu de transport, y plonger l’écouvillon et refermer. Si la tige de l’écouvillon est longue, la casser pour pouvoir refermer le tube.
-          Faire un nouveau pansement.
Conversation et transport :
Si le transport nécessite plus de deux heures, les prélèvements peuvent être conservés à 2-8°C.
N.B : Les cultures à partir de lésions et ulcères sont fréquemment contaminées par des bactéries de l’environnement. L’écouvillonnage ne reflète pas la vraie cause de l’infection. De ce fait, l’aspiration reste la méthode la plus fiable.


  Echantillons non confirmé
  •     Absence d’étiquette sur le tube.
  •          Identification patient absente, erroné ou incomplète.
  •         Absence de bon de demande d’examen.
  •          Ecouvillon non stérile.
  •          Ecouvillon sec ou ouvert.
  •          Temps et température de transport non respectés.
  •          Absence de milieu de transport si l’échantillon est acheminé au laboratoire plus de 2h après le prélèvement.
  •          Discordance entre le bon de demande d’examen et l’étiquette sur l’échantillon.
  •          Absence de renseignements sur l’endroit ou a été effectué le prélèvement.
  •          Absence de frottis dur la lame.
  •        Ecouvillon acheminé au laboratoire à température ambiante plus de 2 heures après le prélèvement.
  •        Écouvillon acheminé au laboratoire dans les conditions non stériles.      


PRÉLÈVEMENTS EN PARASITOLOGIE


PRÉLÈVEMENTS EN PARASITOLOGIE


Le prélèvement de la selle :

Le malade déposera sa selle, le matin, au laboratoire dans un récipient propre, sec et sur lequel est collée une étiquette portant l’identité du malade. Il faut bien indiquer au patient qu’il doit déposer la totalité de la selle dans le récipient et qu’il ne doit pas y mélanger de l’urine, du papier hygiénique ou des fragments de coton.

Technique du scotch test anal :

Appliquer autour de l’anus du patient la face adhésive d’un petit ruban de scotch le matin avant la toilette et la défécation coller le scotch sur une lame porte objet et examiner au microscope. Cette technique est utilisée pour la recherche des œufs d’oxyures, parfois des œufs de Taenia.

L’examen parasitologique du sang :

Préparation des gouttes épaisses et des frottis minces au bout de doigt :
En tenant la main gauche du malade, paume tournée vers le haut, choisir le 3éme doigt après le pouce (pour les nourrissons, on peut employer les gros orteils). On ne prendra jamais le pouce. N nettoie le doigt avec un coton imbibé d’alcool et à l’aide d’un hémostyle stérile, on pique le bout du doigt.
Le première goutte de sang est essuyée, par contre la deuxième goutte de sang est déposée sur une lame porte objet à un centimètre du bord de la lame pour en faire un frottis sanguin. Une autre goutte sera déposée au centre d’une lame rodée pour en faire une goutte épaisse.
La sérologie parasitaire : sang veineux sur flacon sec.

Prélèvement d’urine :

L’examen parasitologique des urines : recherche les parasites qui séjournent pendant une phase de leur cycle dans les urines. On citera essentiellement les  œufs de schistosoma haematobium et le Trichomonas vaginalis.
Pour le trichomonas vaginalis, en recueille les urines matinales du premier jet qui lavent l’urètre, dans un flacon stérile.
Pour la recherche des œufs de schistosoma haematobium, on recueille soit les urines de fin de miction après un effort (sautillement sur place ou  montée d’escaliers).

Prélèvement mycologique de la peau et des cheveux :

L’examen mycologique de la peau et des cheveux recherche les champignons microscopiques pathogènes responsables des mycoses superficielles.

Prélèvement :

La méthode de prélèvement va dépendre du type et du lieu de la lésion.
Les squames : Dans le cas des lésions cutanées sèches, on récolte les squames à la périphérie des lésions circulaires.
Les squames sont raclées à L’aide d’un vaccinostyle stérile ou d’un bistouri stérile et mises dans une boite de pétri stérile.
Quand on suspecte le Pityriasis versicolore, il est conseillé de prélever les squames superficielles par la technique, scotch test cutané.
En cas de lésions cutanées suintantes, on effectue le prélèvement à l’aide d’un écouvillon stérile préalablement humidifié dans un peu l’eau physiologique stérile.
Les cheveux : On arrache avec une pince fine stérile les cheveux malades, fragiles, cassants au niveau des lésions squameuses du cuir chevelu, évoquant cliniquement une évoquant cliniquement une teigne (plaques squameuses) et on les dépose dans une boite de pétri stérile.

Prélèvements en biochimie


Prélèvements en biochimie 

Les anticoagulants utilisés :
  •     Héparine
  •     EDTA 
  •     CITRATE
  •     Fluorure de sodium
u    utilisation de ces anticoagulants permet :

  1.          Eviter l’attente pour la coagulation
  2.         Diminuer la duré de centrifugation
  3.          Volume de plasma supérieur à celui de sérum.

Ordre de remplissage des tubes :
  1.       Toujours prélever en premier le tube destiné à une étude microbiologique (hémoculture).
  2.        Ensuite les tubes sans aditif (tube sec)
  3.        Les tubes destinés à l’exploration de la coagulation (citrate).
  4.        Les tubes héparines
  5.        Les tubes contenant l’EDTA, du fluorure ou monoiodacétates.

Prélèvement d’origine veineux :

Recommandations concernant les conditions physiologiques et d’environnement :

  1.       Heure de prélèvement : le matin entre 7h à 10h
  2.      Le sujet doit respecter les conditions suivant :
  3.      Ne jamais modifier les habitudes alimentaires la veille de prélèvement sanguin.
  4.    Etre totalement a jeun depuis 10 à 12h. S’abstenir absolument, après le repas du soir de boire n’importe boisson sauf un verre d’eau plate.
  5.  De prendre médicament  sauf nécessité médicale qui sera signalé sur la fiche de prescription.
  6.   Dormir au moins 7h pendant la nuit qui précède le prélèvement.
  7.   Eviter toute activité intense 12h avant le prélèvement.
  8.   Ne pas fumer entre le moment du réveil et celui du prélèvement.


Recommandations concernant la position du sujet ambulant :

Le sujet doit être assis et maintenu au repos pendant 15 minutes au mois avant de procéder au prélèvement.

Recommandations concernant les modalités techniques :

Bras tendu pendant le prélèvement, Serrage du garrot limité à la compression veineuse et la durée totale de la pose est 2 minutes au maximum.
Désinfection à l’alcool
Attendre l’évaporation complète de l’alcool puis prélèvement au pli du coude.
Eviter absolument les contractions musculaires ou massage de l’avant bras.

Échantillons biologiques :

      Sérum :
  • Sur tube de verre sec
  • Laisser au repos une heure au minimum et 2h au maximum a température ambiant.
  • Décoller légèrement le caillot centrifugé 
  • Séparer le sérum du caillot. Éliminer tout prélèvement hémolysé, même légèrement.

      Plasma :
  • Sur tube héparine
  • Mélanger le sang immédiatement après prélèvement.
  • Centrifugation de 1500 à 2000 g pendant 15 min.


Prélèvement des urines :

Procédure de recueil des urines de 24h :
  1.         Vider la vessie le matin au lever
  2.         Jeter ces urines et noter la date et l’heure
  3.         A partir de ce moment là ; dans un récipient  propre fournie par le laboratoire, collecter les urines de chaque miction, tout au long de la journée
  4.         Faites le dernier recueil, le jour suivant, au lever, à la même heure que la veille
  5.         Apporter le récipient au laboratoire le plus vite possible.

      Remarque : il est important d’effectuer correctement la toilette avant le recueil de chaque miction.